年轻肺癌患者的不同体细胞基因组变异

青壮年肺癌相对罕见,但它被认为是具有独特生物学的独特亚组[1]。在 ≤40 岁的患者中,肺癌的发病率为 4%[2],而年龄 ≤45 岁的患者为 5.3%[3]。从特征上讲,女性比男性更容易受到影响;腺癌占绝大多数,并且诊断时疾病经常已发展到晚期。当然,这些患者通常接受积极治疗。
根据最近对年轻肺癌患者的研究,EGFR 和 ALK 畸变等可抑制基因组靶标可能在群体中更为富集[2]。此外,还存在有关 HER2 和 ROS1 改变的趋势。Hsu 等人发现有和无 EGFR 突变的年轻肺癌患者的生存率没有显著差异[4]。但是,尚未完全了解更广泛的基因组景观和相关的致癌途径。

 

与 TCGA 基因重叠

因此,Wu 等人基于成对正常血液 DNA 和福尔马林固定、石蜡包埋的基因组 DNA,对 27 名年龄 ≤45 岁的中国 NSCLC 患者(中位数,40;范围,31-45)进行全外显子组测序 [5]。18 例患者患有腺癌,并且 21 例为女性。所有这些人从不吸烟或在诊断时未吸烟。研究人员确定了腺癌(AD)和鳞状细胞癌(SC)体细胞变异,它们分别以 288 和 151 AD 和 SC 变体结束。在基因组变体类型中,移码变异和错义变体在 AD 和 SC 中占主导地位()。对于两种组织,约 60% 存在插入或缺失多态性(插入缺失),约 40% 存在 SNP。两个同期群中的大多数突变基因,与在每个疾病亚型的年轻人 NSCLC 癌症基因组图谱(TCGA)同期群中获得的突变基因重叠(即,94 个 AD 突变基因中的 86 个和 48 个 SC 突变基因中的 41 个)。
选择具有预测高影响突变的基因用于途径分析,产生在组织学上不同的体细胞改变候选途径。例如,ERK/MAPK 信号传导和 PTEN 细胞周期停滞在 ER 中而非在 SC 中改变。反之,Trk/PI3K 信号传导和 ADP 核糖基化/DNA 修复在 SC 而非在 AD 中改变。正
在进行进一步的生物信息学分析,以比较年轻患者与年龄较
大的 TCGA 同期群的突变基因
和途径。

图:年轻患者的基因组变异类型与肺腺癌(AD)或鳞状细胞癌(SC)有关
图:年轻患者的基因组变异类型与肺腺癌(AD)或鳞状细胞癌(SC)有关

 

 

参考

  1. Luo W et al., Characteristics of genomic alterations of lung adenocarcinoma in young never-smokers. Int J Cancer 2018 Apr 18. doi: 10.1002/ijc.31542. [Epub ahead of print]
  2. Sacher AG et al., Association between younger age and targetable genomic alterations and prognosis in non-small-cell lung cancer. JAMA Oncol 2016; 2(3): 313-20
  3. Zhang J et al., Multicenter analysis of lung cancer patients younger than 45 years in Shanghai. Cancer 2010; 116(15): 3656-3662
  4. Hsu CL et al., Advanced non-small cell lung cancer in patients aged 45 years or younger: outcomes and prognostic factors. BMC Cancer 2012; 2012 Jun 13; 12: 241
  5. Wu X et al., Whole exome sequencing (WES) to define the genomic landscape of young lung cancer patients (pts). J Clin Oncol 36, 2018 (suppl; abstr 12005)

 

Author: Judith Moser, MD

Lecture Board: Maximilian Hochmair, MD

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